磷酸化和非磷酸化的抗体主要区别有：

　　1.磷酸化抗体的检测的是出于活性状态（磷酸化）的蛋白。

　　2.磷酸化抗体只针对磷酸化位点设计，是一种位点特异性的多抗，这到有些单抗的特性。3.普通抗体的合成（多抗）：原核表达蛋白->纯化->免疫动物->收获抗体。

　　4.磷酸化抗体合成：人工合成含磷酸化位点的多肽->人工体外磷酸化->链接半抗原->免疫动物->收获抗体。

　　5.磷酸化的蛋白很大部分是转录相关因子。因此使用磷酸化抗体和普通抗体。检测同一个蛋白，原位检测可能具有不同的细胞定位。转录因子磷酸化后由细胞质进入细胞核。

　　6.一般而言，磷酸化蛋白的实验结果与分子功能更直接相关。

　　非磷酸化抗体是测该蛋白的含量，不能知道其活性状态，磷酸化抗体是测该蛋白的磷酸化水平如何，侧重于了解该蛋白的一种活性状态。

　　磷酸化抗体主要是针对磷酸化位点制备的,检测该蛋白在细胞受到刺激时该蛋白的变化情况(磷酸化水平增强还是减弱)。

　　非磷酸化抗体(主要针对非磷酸化位点的肽段制备的)主要检测组织或细胞中该蛋白的表达情况,组织分布或细胞中定位,同时可以作为磷酸化水平变化的内参等.。